L'Altare Maggiore e la cappella angioina

L'altare maggiore fa corpo unico con la nicchia di forma ogivale che la sovrasta. La struttura nasce nei secoli addietro come unico progetto atto a valorizzare già da subito il complesso devozionale del luogo. La copertura esterna è a doppio spionvente realizzato in chiancarelle tipiche del territorio, mentre l'arco interno è a sesto acuto. La cavità artificiale così composta ospita al suo interno, appunto l'altare e i sedili, sempre in pietra, per i ministranti la funzione liturgica devozionale.

L'edificazione di tale nicchia a forma di casa all'interno della grotta, quindi comunque un luogo di per se già protetto, manifesta una forte sacralizzazione del posto, una "casa nella casa" equivale a dire "Sacralizzare il Sacro".

La parete frontale a contatto diretto con la roccia presenta una decorazione ad affresco  con la rappresentazione della Crocifissione di Cristo. L'affresco è steso in un unico strato di intonaco ed è stato realizzato simultaneamente da due artisti pugliesi. Le mani differenti si notano sia dal punto di vista concettuale che di modalità di rappresentazione del contenuto. Tale affresco risale all'incirca al XIV Sec in piena età angioina.